桌面显示器显示蔡司arivis Pro软件的屏幕,其中包含聚焦离子束扫描电子显微镜体电镜数据核孔复合体的分析结果。
软件

蔡司arivis Pro

高级图像分析和可视化解决方案

利用我们强大的图像分析和可视化工具充分发挥成像潜力。您只需点击几下,即可创建无缝分析流程,并在兼容的工作站上轻松处理大量数据集。使用我们的VR Toolkit“走进样品”,获得全新视角。

  • 用于常规或定制工作流的即点即用型解决方案
  • 整合各类操作用于灵活的流程
  • 兼容多种成像文件格式
  • 支持定制和开源人工智能模型
  • 通过GPU驱动的三维引擎对大数据进行可视化处理
一位女科学家正在显微镜实验室中工作,桌面显示器显示蔡司arivis Pro软件的屏幕,其中包含聚焦离子束扫描电子显微镜体电镜数据核孔复合体的分析结果。背景中有另外两位科学家。

强大的互动工具助您创建灵活流程

蔡司arivis Pro助您轻松创建灵活的图像分析和可视化流程,协助进行研究。借助传统方式或人工智能模型,无需编写代码,即可轻松创建适用于各种图像尺寸、维度或模式的流程。

该软件支持并精于处理超过30种商业文件格式,即便面对大型文件,依然轻松高效。针对简单或复杂的分析任务,可提供预设置的流程和标准的分析方案,同时支持为特定目标定制专属流程。

只需轻松一键,即可重复分析,获得准确稳定的定量结果。该软件助您提高效率,并确保获得可重复的结果。

基于聚焦离子束扫描电子显微镜图像人工智能模型的亚细胞分析

基于人工智能模型的聚焦离子束扫描电子显微镜图像的亚细胞分析

基于聚焦离子束扫描电子显微镜图像人工智能模型的亚细胞分析
由欧洲分子生物学实验室的Anna Steyer和Yannick Schwab提供。
由欧洲分子生物学实验室的Anna Steyer和Yannick Schwab提供。

高级三维分析

借助人工智能进行多维图像分析,快速获取结果。您可以通过在Z轴序列图像中的某一层进行标注来训练模型的图像分割和分类,并将其应用于整个数据集。在本地使用机器学习和深度学习运算符,或在云端训练模型,然后将其导入以形成灵活流程或分析的核心。只需点击几下,便能以三维方式显示结果或创建视频,生成出色的分析报告。

三维类器官分析

三维类器官分析

三维类器官分析
样品由Lutholf实验室提供,由蔡司客户中心的Frank Vogler进行成像

高内涵分析

为深入研究药物,需要采用先进的图像分析方法,例如针对更广泛的细胞或组织表型进行筛选,逐步从二维扩展至四维。使用蔡司arivis软件,您可以在云端或本地训练人工智能模型,同时自动进行图像分析以节省时间、减少人为偏差并获得准确稳定的结果。

使用蔡司arivis Pro VR进行追踪

使用蔡司arivis Pro VR进行追踪

使用蔡司arivis Pro VR进行追踪
样品由德国德累斯顿工业大学的Gunar Fabig博士提供
样品由德国德累斯顿工业大学的Gunar Fabig博士提供

追踪和谱系

对细胞分裂和迁移表型进行量化,可追踪任意尺寸的二维及三维图像集的动态变化。蔡司arivis Pro VR助您在沉浸式VR环境中准确校对自动生成的追踪信息,轻松将流程重新应用于更多数据集。

神经元组织(小鼠大脑)的自动三维神经元追踪。

神经元组织(小鼠大脑)的自动三维神经元追踪。

神经元组织(小鼠大脑)的自动三维神经元追踪。  由德国奥伯科亨蔡司研究显微镜解决方案业务部门客户中心的Steffen Burgold博士提供。
由德国奥伯科亨蔡司研究显微镜解决方案业务部门客户中心的Steffen Burgold博士提供。
由德国奥伯科亨蔡司研究显微镜解决方案业务部门客户中心的Steffen Burgold博士提供。

神经生物学

使用先进的神经元追踪算法,只需点击一下,即可对各类图像进行自动、可重复的分析。即使信噪比(SNR)较低,依然能对神经元、胶质细胞/小胶质细胞和轴突等进行量化。使用我们的半自动交互式VR工具,轻松编辑追踪信息,无论图像格式如何,均可分析过去的实验数据。

30日龄章鱼。样品由Montserrat Coll Lladó、Jim Swoger/EMBL Barcelona和Roger Villanueva/ICM-CSIC提供
30日龄章鱼。样品由Montserrat Coll Lladó、Jim Swoger/EMBL Barcelona和Roger Villanueva/ICM-CSIC提供
30日龄章鱼。样品由Montserrat Coll Lladó、Jim Swoger/EMBL Barcelona和Roger Villanueva/ICM-CSIC提供
30日龄章鱼。样品由Montserrat Coll Lladó、Jim Swoger/EMBL Barcelona和Roger Villanueva/ICM-CSIC提供

蔡司arivis Pro VR Toolkit

借助沉浸式虚拟现实体验,用全新视角观察样品。您可以直接移动、旋转、缩放和塑造您的数字图像数据,不受键盘和鼠标的束缚。体验可与现实世界相媲美的深度感知。

  • 以三维形式探索样品
  • 多角度观察细节
  • 与同事协作,实时查看样品和结果
  • 轻松进行语音和手动控制
  • 对自动分析结果进行有效的交互式校对和编辑
转换30多种图像文件格式

转换30多种图像文件格式

无论您通过什么设备创建图像,无论使用何种格式或文件大小如何:蔡司arivis SIS转换器均可轻松将您的图像文件转换为可扩展图像存储(SIS)格式,以便使用蔡司arivis Pro、arivis Pro VR和arivis Hub快速、交互式地探索您的图像。您可以节省大量时间,同时保留所有数据以进行高级分析。

  • 支持30多种格式的文件转换
  • 对多个导入和转换任务进行队列排序
  • 无人值守的批量转换
  • 易于使用的文件转换任务管理界面
  • 还可处理除显微镜图像外的其他图像(如CT、MRI)

新版arivis Pro产品亮点

了解您能否从新版蔡司arivis Pro的可用功能中受益。
  • 蔡司arivis 4.4支持人工智能驱动的多孔板分析
    2025年9月30日发布

    • 多孔板批量处理:通过实时监控、无缝导航,以及直接上传至arivis Hub进行大规模并行处理,优化多孔板和视野的分析流程。
    • 人工智能辅助的注释:利用人工智能辅助,加快对象标记和深度学习训练。人工智能辅助的二维切片注释与自动插值相结合,能够简化手动三维分割流程。
    • Cellpose-SAM基础模型:在多种成像条件下(包括不同的通道、细胞大小、噪声水平、分辨率和模糊程度),以更高的可靠性使用专家级的生物分割功能。
    • 增强的四维可视化效果和更快的视频导出:图像旋转控制直观易用,切面角度可调,只需简单操作手柄,即可从任意角度观察三维体积。并提供Quick Movie模式,可将视频生成速度提升至15倍。VR模式现支持显示神经元追踪结果和树突棘结构。
  • 在神经元显微镜图像上追踪并分割树突棘
    在神经元显微镜图像上追踪并分割树突棘

    蔡司arivis Pro 4.3让图像分析变得更加轻松
    发布于2025年3月11日

    蔡司arivis Pro 4.3显著提升了图像分析能力。以下是主要新功能的概览。

    核心改进:

    • 人工智能辅助的树突棘追踪:使用预训练的人工智能模型和经典方法自动检测树突棘,实现高级神经元结构分析
    • 增强了适用于HCA的细胞测量:扩展的测量功能支持更丰富的特征集,适用于Cell Painting和其他高内涵分析(HCA)应用
    • 支持原生CZI:确保蔡司成像与分析平台之间的格式一致,并通过直接文件处理简化工作流,无需中间转换步骤
    克服堆叠状渲染效果
    克服堆叠状渲染效果

    其他改进

    • 支持新的文件格式:扩展了arivis Pro读取多种显微镜文件格式的能力,为使用不同成像平台的设备提供支持。
    • 性能优化:用于深度学习 
      • 更快的基于实例分割的深度学习处理速度
      • 进一步提高共享内存利用率
      • 为虚拟机和蔡司arivis Hub提供扩展的实例分割支持
    • 可预览的本地深度学习训练器:用户可逐平面评估训练模型的分割质量,即时反馈性能,无需执行完整的三维分析流程
    • 可视化改进:在4D Viewer中的表面渲染经过增强,可创建更自然的三维可视化效果,尤其在实例分割结果中,消除了分割对象的“堆叠”外观
  • 量身定制是显微镜图像分析的重中之重
    发布于2024年6月19日

    蔡司arivis Pro 4.2让用户可以自由选择适合其需求的图像分析方法。

    新版本包括增强的人工智能驱动工具、三维分析功能和大型数据集处理。该软件十分灵活,可量身打造显微镜图像分析工作流,助您为研究问题寻找答案。

    观看本短视频了解更多关于新功能的内容。

    drip cellpose

    drip cellpose

    drip cellpose

    所含内容

    新功能和重要内容

    • 优化网格划分和渲染,可在4D Viewer中处理不限量的对象 
    • 由在蔡司arivis Cloud上训练的深度学习模型驱动实例(基于对象)分割
    • 使用Cellpose操作对显微镜图像中的细胞和细胞核进行分割 
    • 分析流程中的高精度预览可处理三维数据,生成更有意义的预览效果 
    • 分析可直接在4D Viewer中显示对象创建操作的预览(例如Neuron Tracer) 
    • 机器学习可自动优化使用的功能集(以提高性能) 
    • 改进了对对象表中大量对象的处理 
    • 已完成品牌重塑:软件现命名为蔡司arivis Pro

支持的图像文件格式

    • Abberior Inspector (.obf, .msr)
    • AmiraMesh (*.am)
    • Aperio SVS (*.svs)
    • arivis Single Image Stack 3 (*.sis)
    • BigDataViewer文件格式 (*.xml)
    • CompuServe GIF (*.gif, *.giff)
    • DeltaVision图像文件 (*.dv)
    • DICOM Directory (*.dicomdir, *.DICOMDIR)
    • DICOM Image (*.dcm)
    • Fiji/ImageJ-TIFF (*.tif, *.tiff)
    • GE InCell (*.xdce)
    • Hamamatsu tiff类文件格式 (*.ndpi)
    • High Dynamic Range Image (*.hdr)
    • ICS 1.0/2.0文件格式 (*.ics, *.ibs)
    • Imaris IMS (*.ims)
    • Inspector (*.obf/*.msr)
    • JPEG/JFIF (*.jpg, *.jpeg, *.jif, *.jfif, *.j, *.jpe)
    • JPEG-2000 (*.jp2, *.j2k, *.j2c)
    • Leica图像文件格式 (*.lei,*.lif)
    • Luxendo图像 (保存为BigDataViewer *.xml)
    • Metamorph STK (*.stk)
    • Mirax SliceAC文件格式 (*.mrxs)
    • Molecular Devices (GE IN Carta)
    • Neuroimaging Informatics Technology Initiative图像文件格式 (*.hdr, *.nii, *.nii.gz)
    • Nikon ND2文件 (*.nd2)
    • Olympus文件格式 (*.oir, *.oib, *.oif)
    • Olympus Media Handler (*.vsi)
    • OME-TIFF (*.tif, *.tiff)
    • OME-TIFF/FEI (*.tif, *.tiff)
    • OME-TIFF/LaVision (*.tif, *.tiff)
    • Perking Elmer PE (标准PE格式, .qptiff Columbus元数据)
    • Portable Network Graphics (*.png)
    • Slidebook (.sld) Media Handler
    • TIFF标签图像 (*.tif, *.tim, *.tiff)
    • TillVision文件格式 (*.rbinf, *.ini)
    • TrakEM2 Image文件格式 (trakem2.xml, *.xml)
    • VGI/VOL Media Handler
    • VG Studio Max (*.vgl)
    • VG Studio Images VOL Media Handler (*.vol, *.vgi)
    • Virtual Microscopy Specimen文件格式 (*.vms, *.vmu)
    • Windows Bitmap (*.bmp, *.rle, *.vga, *.rl4, *.rl8, *.sys)
    • 蔡司Axiovision ZVI (*.zvi)
    • 蔡司CZI/ZISRAW (*.czi, *.zisraw)
    • 蔡司LSM-tiff (*.lsm)
    • Yokogawa CV (*.mlf)
    • Yokogawa CPf (*.mmd)

下载

  • Overcoming 3D Visualization Artifacts in Deep Learning-Based Bioimage Analysis

    1 MB


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