细胞成像
支持细胞计数、形态特征量化、空间关系分析、共定位分析、细胞追踪、批处理分析等功能,轻松应对细胞样本、活细胞、类器官等不同研究领域。
数据来自Smmith JJ, et, al. Annu Rev Anim Biosci. 2021
七鳃鳗胚胎细胞核及微核分析
使用arivis的机器学习功能可以轻松识别七鳃鳗胚胎的细胞核及周边微核并对其进行准确地分割。并结合机器学习分类器的功能将细胞核与微核区分,从而计算细胞核与微核的数量并分析两者之间的关系,了解其基因重组过程中DNA丢失的机制。
数据来自Celia Smits, Stanislav Y. Shvartsman, Department of Molecular Biology, Princeton University
果蝇胚胎发育研究
使用arivis的细胞追踪工具对果蝇胚胎发育过程中的细胞谱系进行自动追踪,探索细胞的分裂和分化过程。
数据来自Stone Elworthy and Emily Noël, School of Biosciences, University of Sheffield, UK
研究发育斑马鱼心脏的形态和心壁运动
受精后 3 日跳动的斑马鱼胚胎心脏,使用 mCherry 标记心肌细胞核。在 1.2 秒内使用 Lightfield 4D 采集 3 次完整心跳。使用 arivis Pro 进行细胞分割和跟踪,可以清楚地看到,心肌细胞在每次心跳中都遵循完全相同的轨迹。
自动追踪细胞动态轨迹
使用arivis Pro自动追踪细胞在运动过程中的动态轨迹,并可以对轨迹进行手动编辑及后续分析,了解细胞运动的速度、距离、方向、分裂及融合等信息。
数据来自Lotta Hof, BioRxiv, 2020
肝脏类器官发育过程的细胞迁移规律分析
使用arivis的AI分割允许对因快速拍摄而牺牲分辨率的活体成像结果进行准确得分割工作。再结合细胞追踪,即可追踪类器官发育的细胞迁移过程。且可将量化的追踪结果三维可视化,不同迁移速度赋予不同颜色,发现位于类器官“两级”的细胞倾向于较少或缓慢的迁移。
样品来自InSphero AG, Schlieren, Switzerland
透明化细胞团结构的分割与重构
HCT-116-GFP(结肠癌)/NIH-3T3-RFP(成纤维细胞)共培养细胞的透明化细胞团,细胞核用Hoechst 染色。在 InSphero Akura 培养板上成像。使用 arivis Pro 对数据集进行分割。
LLC-PK1细胞及细胞器空间分析
利用arivis对细胞核内信号进行距离测量,并用信号的渲染颜色(由紫色到红色)表示信号与核膜(黄色)的距离。
拟南芥树根的细胞膜分割
利用arivis中的膜结构提取工具分割植物根尖细胞,还可使用膜结构处理工具对不连续的细胞膜信号进行增强,使分割结果更加准确。