蔡司 CZI 图像文件格式

CZI

显微镜图像格式

CZI

  • 介绍

    在一个文件内包含了所有重要数据。安全且可重复。

    CZI 文件格式由蔡司专为满足显微镜成像需求而开发。ZEN 成像软件将多维图像,如时间序列Z 轴序列多位点实验虚拟切片保存至此文件格式中。CZI 会将成像数据与所有相关元数据信息合并成一个压缩文件。 

    越来越多的项目和企业已经在他们的应用中使用并支持 CZI 格式

     

    • OME Bio-Formats / OMERO
    • Fiji & ImageJ
    • Python (via python-bioformats or czifle.py)
    • CellProfiler
    • Icy
    • KNIME
    • MATLAB
    • Visiopharm
    • Imaris
    • Da-Cons
    • HS-Analysis
    • arivis Browser / arivis Vision4D
    • MicrBrightfeld
    • Indica Labs
    • Image Pro
    • Amira
    • Definiens
    • microDimensions
    • Orbit
    • QuPath
    • digitallabware
  • 显微镜和图像数据

    元数据始终可用。

    除图像外,此文件格式还能保存如下元数据

    • 采集日期、关键字,用户注释
    • 显微镜型号和设置
    • 激光或照明强度
    • 维度和比例尺
    • 使用的观察方式和物镜
    • 荧光染料和滤色片
    • 载物台(x,y)和聚焦(z)位置
    • 相机和检测器参数,如曝光时间、像素合并方式、位深、像素停留时间
    • 自动添加或用户定义的图形元素和标注
    • 样品条形码信息

    始终提供的这类信息意味着即便是数多年后,您仍然可以在相同条件下重复您的实验。如果您需要与同事们共享这些图像,可以使用免费版 ZEN lite 软件查看并处理 CZI 格式图像。

    如果您还希望使用其他软件处理和分析 CZI 图像,我们非常乐意为您提供内部 CZI 文件格式的资料文档,帮助您完成工作。请按照注册链接,填写 CZI 开发人员登记表格,获取您的免费文档注册文件。之后我们会将文档发送给您。

  • Mac OS 和 Linux

    用于开放式研究的开放源软件

    蔡司的 ZEN 软件和显微成像工作站需要在 64 位微软 Windows 操作系统下运行。为支持诸如 Mac OS X 或 Linux 等其他操作系统,蔡司提供了协同工作所需的开放资料文档并与伙伴项目和企业建立合作关系。

    使用 ZEN 软件和蔡司显微镜系统创建的图像能够以全文档化的文件格式 CZI 进行保存。如果您希望在非 Windows 操作系统下浏览和处理这种文件格式的数据,我们建议您访问 ImageJ 和基于 ImageJ 的 Fiji 软件包主页。这类开源成像程序的预编译安装文件适用于 Mac OS X 和基于 Linux 的系统,以及大量用于图像分析和处理的插件。开放显微成像软件包的 Bio-Formats 插件支持 CZI 图像和元数据导入。

    很遗憾,蔡司显微镜事业部无法为这类应用的用户提供具体帮助。但蔡司会为开放源软件项目和论坛提供指定显微镜产品的开发人员访问端口及资料文档和 SDK。如果您对软件开发感兴趣,则可以注册免费获取 CZI 资料文档。

即刻联系蔡司公司了解更多有关 CZI 的信息!